A FATEO possui vários cursos de pós-graduação. 

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Pós-graduação em Família (mar/2022-set/2023) - em andamento

Parceria com o Instituto São João Paulo II

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Pós-graduação em Missiologia (jan/2023-jan/2024) - em andamento

Parceria com o Centro Cultural Missionário

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Pós-graduação em Logoterapia (jul/2023-jan/2025) - previsto 

Instituto Bíblico Asa Norte​

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